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      5hmC或成为2型糖尿(niào)病血管并发症(zhèng)临床(chuáng)监控的(de)重要标志物

      source:TIME:2019-10-01 08:00:00分享到:

      2019年10月1日,5-羟甲基化胞嘧(mì)啶(5-hydroxymethylcytosine,5hmC)在(zài)糖尿病研究领域取得重要进展。2型(xíng)糖尿病(T2D)的血管并发症(zhèng)是导(dǎo)致2型(xíng)糖尿病致残致(zhì)死的重要病因,一直缺乏一(yī)种无创便捷的临床途径实现(xiàn)血管并发症(zhèng)的发生发展监测,达到早发现、早干(gàn)预,以提高T2D病人的整体生(shēng)活质量,减少卫生经济负担。


      该研究入组(zǔ)了(le)62例(lì)2型糖尿(niào)病病(bìng)人,采用(yòng)5hmC-Seal技术(shù)对血浆cfDNA中表观遗传(chuán)标志物5hmC的分布情况进(jìn)行检(jiǎn)测,分析5hmC标志物与2型糖(táng)尿病血管并发症发(fā)生发展(zhǎn)的相关性。结果表明5hmC标(biāo)志物的变化(huà)与T2D合并(bìng)大血管/微血管事件具有相关性,主要涉及一些与(yǔ)血管(guǎn)生物学和糖(táng)尿病(包(bāo)括胰岛素耐(nài)受和炎症反应)相关的基因和(hé)信号通路。该(gāi)研究建立的16个基因-5hmC标志物组合检测(cè)可以准确区分(fèn)有并发(fā)症和无(wú)并发症的(de)2型糖(táng)尿(niào)病病人[实验组:AUC=0.85;95% CI,0.73-0.96],明(míng)显优于传统(tǒng)临床变量例如白(bái)蛋(dàn)白尿。除此之外(wài),还建立了13个(gè)基因-5hmC标志物组合检测,可以进一步区分(fèn)T2D合并单一并发症和多(duō)种(zhǒng)并发症[实验组:AUC=0.84;95% CI,0.68-0.99],同(tóng)样明显优(yōu)于其他传统(tǒng)临床变量。该研究得出结(jié)论(lùn),5hmC标志物反映(yìng)了(le)T2D病人大血管/微血管并发症(zhèng)发(fā)生过程中的表观遗传变(biàn)化(huà),因而5hmC-Seal检(jiǎn)测技术在监测(cè)糖尿病血(xuè)管并发症发生和进展(zhǎn)方面具有(yǒu)良(liáng)好的临床应用前景。


      试验设计



      本研究共(gòng)纳入62例2型糖(táng)尿病病人,包括没有(yǒu)血管并(bìng)发症的病人12例,有单一(yī)血管并发症的病人34例(24例发生(shēng)大血管事件(jiàn),10例发生微血管事件),以及有(yǒu)多种血(xuè)管并发症(zhèng)的(de)病人16例。试验收集62例病人血浆,提取cfDNA,利用5hmC-Seal技术捕(bǔ)获外周血cfDNA中的(de)5hmC序列,进行二代测序,通过生物信息学分析找(zhǎo)出并发症组与无(wú)并发症组(zǔ)之间有显著5hmC修饰差异的基因(yīn),单一并发症组和多种并发症组(zǔ)之(zhī)间有显著5hmC修饰差异的基因。随后利用回归模(mó)型对差(chà)异(yì)基因进(jìn)一步筛选、优化,弹性网络(luò)进(jìn)一(yī)步筛选,计算加权平(píng)均分,最(zuì)后得到一组具有高度(dù)灵敏度和(hé)特异性的5hmC生物(wù)标记物,并(bìng)进一(yī)步在(zài)实验组中验(yàn)证,分(fèn)析其灵敏度和特异性。并将新建立(lì)的5hmC标志物基(jī)因组合的检测性能与传统临床变量进行对(duì)比分析。最(zuì)后对相(xiàng)关基因(yīn)进行了(le)信号通路分析和功能探究(jiū)。



      研究结果


      5hmC修饰水平与血管并发症具有相(xiàng)关性(xìng)


      利用逻辑回归模型对62例有并发症和无并发症2型糖尿病病人的5hmC差异水平进(jìn)行(háng)分析发现,有(yǒu)并发症2型糖尿病病人的622个差异修饰候选基因(包括上调和(hé)下调基(jī)因)的归一(yī)化平均(jun1)数要明显高于无并发(fā)症的病人(P<0.001),但是单一并发症(zhèng)和多发并(bìng)发症病人之间没(méi)有显著差异。

      之后将有单一并发症或多种并发症的50例病人用逻辑回归模(mó)型进行了对比,发现多种并发(fā)症的病人(rén)的153个差(chà)异修饰候选基因(包括上(shàng)调和下调基因(yīn))的归一(yī)化平均数要低于无并(bìng)发症病(bìng)人(P<0.001)。


      5hmC标(biāo)志(zhì)物可区(qū)分有无并发症(zhèng)患者


      62例2型糖尿病病(bìng)人被随机分成训练(liàn)组(n=31)和测(cè)试组(n=31)。利(lì)用(yòng)弹性网络筛选(xuǎn)后发现,16基因-5hmC标志物组(zǔ)合检测可以用于区(qū)分有(yǒu)并发症(zhèng)和无并发症的2型糖尿病(bìng)病人(rén)。


      基于16基因组合模型 (Detection Model 1) 的加权(quán)平均分分析,发现无并发症病人的(de)分数在训练集和测试集中(zhōng)都明(míng)显(xiǎn)低于有并发症的病人(rén)。只考虑加权平均分(fèn)的话(huà),受试者(zhě)工作特征曲线(xiàn)(ROC)分(fèn)析(xī)表明将cutoff值(zhí)设(shè)置(zhì)成0.5时,在测试(shì)组中中(zhōng)的灵敏度(dù)为60%,特异性为(wéi)100%。



      5hmC标(biāo)志物可区分病人是单一并发症还(hái)是(shì)多种并发症


      50例有并发症的(de)2型糖尿病病人被随机分成训练组(zǔ)(n=25)和测试组(n=25)。利(lì)用弹(dàn)性网络(luò)筛选后发现,13基因-5hmC标志(zhì)物组合可以区分2型(xíng)糖尿病病人(rén)是否发(fā)生单一并发症或多种并发症。


      基于(yú)13基因(yīn)组合模型 (Detection Model 2), 我们计(jì)算了单一并发症和多种并(bìng)发症(zhèng)的加权平均分,发现(xiàn)在训练集和测试集中单(dān)一并(bìng)发症和多种并发(fā)症病(bìng)人的分数(shù)都有明显差异。值得一提的(de)是,有(yǒu)肾(shèn)病并发症和无肾病并发症病人的分(fèn)数也(yě)有明显差异。利用加权平均分(fèn)作为判断(duàn)标准的(de)受试者工作特征曲线(ROC)表明,在测试组中当将cutoff值设成0.69时,灵敏度为87.5%,特(tè)异性为68.8%。



      5hmC标(biāo)志物(wù)与传统临床变量/危险因(yīn)子的对(duì)比


      我们评估了(le)不(bú)同临(lín)床变(biàn)量(liàng)/危险因(yīn)子用于监测(cè)血管(guǎn)并发症(zhèng)的(de)灵敏度和特异(yì)性(见表1)。

      总体(tǐ)来说,结(jié)果(guǒ)表明一些临床变量(如尿液白(bái)蛋白、血清ALT、AST、肌酐、GGT、脂(zhī)蛋白(bái)a)虽(suī)然具有一定(dìng)的灵敏度(dù)和特异性,但是整体准确度仍(réng)然差强人意(yì),因此临床需要(yào)更加准确的(de)方法(fǎ)。另外(wài),我们还(hái)在训练组中建立5hmC和不同临(lín)床变量(liàng)的(de)多变(biàn)量组合模型进行评估,该(gāi)模型加权平均分的AUC要(yào)明(míng)显大于传统临床变量的AUC。若(ruò)将(jiāng)这些临床变量与加权(quán)平均分进行结合(hé),AUC也将进一步提高(gāo)。因(yīn)此,该(gāi)多变量(liàng)模型表明加权平均分可作为一个独立的(de)指(zhǐ)标用于(yú)监测2型糖尿病血管并发症。

      信(xìn)号通路分析和(hé)功能(néng)探究


      有并发症(zhèng)和(hé)无并(bìng)发症病人的135个差异候选基(jī)因的功(gōng)能注释分析表明,这些基(jī)因主要富集在一些经典(diǎn)的信号(hào)通(tōng)路。错误发现率相关P值(zhí)位于前10%和基因数(shù)目≥3的信号通路包(bāo)括由(yóu)IGF1R, IL-10和FGFR2所(suǒ)介导的信号通路。由IGF1R和IL-10介(jiè)导的信号通路与胰岛素抵(dǐ)抗及炎症反应相关,在(zài)血管生(shēng)物学和糖尿病发生发展过(guò)程中发(fā)挥重要作用。

      Reactome相互作用(yòng)网(wǎng)络的中心表明,泛素编码基因[泛素B (UBB),泛素C (UBC),泛素A-52亚(yà)基核糖(táng)体蛋白融合产物(wù)1(UBA52)]是候选基因(如SMAD3FOXD2DRAP1MCIDASMLNPIANPTBCC)的重要连接者。在这135个(gè)差异候(hòu)选基因中, 一些基因 (如TNFRSF25P=0.027, HR=6.25; MLNP=0.0021, HR=20.40; CCL3L1P=0.018, HR=0.44)表现(xiàn)出与糖尿病病程相关的倾向,表明(míng)5hmC和糖尿病血管并(bìng)发症之间可(kě)能存在(zài)时间依赖性的(de)相互(hù)作用。基于纵向时间队列的大样本研究,将(jiāng)可进一步明确(què)5hmC变化和糖尿病持续时间之间(jiān)的动(dòng)态关(guān)联。关于单一并(bìng)发症和多(duō)种并发(fā)症病人的159个候(hòu)选标志(zhì)基因的功能注释研究发现(xiàn),存(cún)在细胞-细胞连接、胶(jiāo)原蛋白形成、新陈代谢、细胞(bāo)应激应答信号(hào)通路的富(fù)集,这些信号通路(lù)均与细(xì)胞基本功能(néng)密切相关。


      研究(jiū)意义(yì)



      血管(guǎn)并发症是(shì)三分之二(èr)糖(táng)尿病病人的(de)死亡原因,若能及早有效控制(zhì)血管并发症的(de)发生,将(jiāng)极大地(dì)改善糖尿病(bìng)病人的生存(cún)质(zhì)量(liàng)。该研究(jiū)建立了一种利用cfDNA进行2型(xíng)糖尿(niào)病(bìng)血(xuè)管并发(fā)症(zhèng)监测(cè)的无创便捷方法,较目(mù)前临床(chuáng)标志物能更(gèng)准确(què)地监控(kòng)血管并发症(zhèng)的发生(shēng),从而提示临床及早(zǎo)采取应对措施(shī),有效控(kòng)制病(bìng)情进(jìn)展(zhǎn)。



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