华体平台-华体(中国)



  • <ayim class="zbzif"></ayim>
      欢迎访(fǎng)问合(hé)肥中科金(jīn)臻生物医学有限(xiàn)公司(sī)官网! 加(jiā)入收藏 |联系我们
      &#21326;&#20307;&#24179;&#21488;&#45;&#21326;&#20307;&#40;&#20013;&#22269;&#41;
      locations: 首(shǒu)页 - 新闻中(zhōng)心 - 公司新闻

      5hmC或成为2型糖尿病血管并发症(zhèng)临床(chuáng)监控的重要标志物

      source:TIME:2019-10-01 08:00:00分(fèn)享(xiǎng)到(dào):

      2019年10月1日(rì),5-羟甲(jiǎ)基化胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5hmC)在糖(táng)尿病研(yán)究领域取(qǔ)得重要进展。2型糖尿病(T2D)的血管并发症(zhèng)是导致2型糖尿病致残(cán)致死的重要病因,一直缺乏一(yī)种(zhǒng)无创便捷的临床途径实现血管并发症的(de)发生发展监测,达(dá)到早发现、早干预,以提高(gāo)T2D病人(rén)的整体(tǐ)生(shēng)活质量,减少卫(wèi)生经济负担。


      该研究入组了62例2型(xíng)糖尿病病人,采用5hmC-Seal技术(shù)对血浆cfDNA中(zhōng)表观遗(yí)传标志物5hmC的分布情况进行检(jiǎn)测,分析5hmC标志(zhì)物与2型(xíng)糖(táng)尿病血管并发症发生发(fā)展的相关性。结果表明5hmC标(biāo)志物的变化(huà)与T2D合(hé)并大血(xuè)管(guǎn)/微(wēi)血管事件具有相关性,主要涉及一(yī)些与血(xuè)管生物学和糖(táng)尿病(包括胰(yí)岛素(sù)耐受(shòu)和炎症反应)相关的基因和信(xìn)号通路。该研(yán)究建立(lì)的16个基因-5hmC标志物组(zǔ)合检测可以准确区分(fèn)有(yǒu)并发症(zhèng)和无并发症的2型(xíng)糖尿(niào)病病人[实验组(zǔ):AUC=0.85;95% CI,0.73-0.96],明显优(yōu)于传统临床(chuáng)变量例如白蛋白尿。除此之外,还建立(lì)了(le)13个基因-5hmC标志物组(zǔ)合检测(cè),可以进一步区分T2D合并单一并发症和多种并(bìng)发(fā)症[实验(yàn)组:AUC=0.84;95% CI,0.68-0.99],同样(yàng)明显优于(yú)其他传统临床变量。该研究得出结论(lùn),5hmC标志物反映了T2D病人大血管/微血管(guǎn)并发(fā)症发生过程中的表观(guān)遗传变(biàn)化(huà),因(yīn)而(ér)5hmC-Seal检测技术在监测(cè)糖尿病(bìng)血管并(bìng)发症(zhèng)发生(shēng)和进展方面具有良好(hǎo)的临(lín)床(chuáng)应用前(qián)景。


      试验设计



      本研(yán)究共纳入62例(lì)2型糖尿(niào)病病人(rén),包括没(méi)有血管并发症的病人12例,有单一血管并发症的病(bìng)人34例(24例发生大血管(guǎn)事件,10例(lì)发生微血管事件(jiàn)),以及有多种(zhǒng)血管(guǎn)并发症的(de)病人16例。试验收集(jí)62例(lì)病人血浆(jiāng),提(tí)取cfDNA,利用5hmC-Seal技术捕获外周血cfDNA中的5hmC序列,进行二代测序,通过(guò)生物信息学分(fèn)析找出并发(fā)症组与无并发症组之间有显著(zhe)5hmC修饰差(chà)异的基因,单一并发症组和多种并(bìng)发症组之间(jiān)有显著(zhe)5hmC修(xiū)饰差(chà)异的基因。随后利用回归模型对差异基(jī)因(yīn)进一步筛选、优化(huà),弹性网络进一步筛选,计(jì)算加(jiā)权平均分,最后得到一组具有高度灵敏度和特异(yì)性的5hmC生物标记物,并进一步在实(shí)验组中验证,分析其灵敏(mǐn)度和特异性。并将新建立的5hmC标志(zhì)物基因组(zǔ)合的检测性能与(yǔ)传统临床变量进行对比分析。最后对相关基因(yīn)进(jìn)行了信(xìn)号通路分析和功能探(tàn)究。



      研究结果(guǒ)


      5hmC修(xiū)饰水平与血管并发(fā)症具有相(xiàng)关性


      利用逻(luó)辑回归模型对(duì)62例有并发症和无并发症2型(xíng)糖尿病病人的5hmC差异(yì)水(shuǐ)平进行分析发现,有(yǒu)并发症2型糖尿病病人的622个差异修饰候选基因(yīn)(包括上调和(hé)下(xià)调基(jī)因)的归一化平均数要明(míng)显高于无(wú)并发症的病人(P<0.001),但是单一并发症(zhèng)和(hé)多发(fā)并发症病人之(zhī)间没有显著差异。

      之后将有单一并发症或多种并发症的50例(lì)病人(rén)用逻辑回归(guī)模型(xíng)进行(háng)了(le)对(duì)比(bǐ),发(fā)现(xiàn)多种(zhǒng)并发症的病人的153个差(chà)异修饰候(hòu)选基因(包括上(shàng)调和下调基因)的归一化平均(jun1)数要低(dī)于无(wú)并发症病人(P<0.001)。


      5hmC标志物可区分有无(wú)并发症患者


      62例2型糖尿病(bìng)病人被随机分成训练组(n=31)和测试组(n=31)。利用弹性网(wǎng)络筛选后发现,16基因-5hmC标(biāo)志物组合(hé)检测可(kě)以用于区分有并发(fā)症和无并发症的2型糖尿病病(bìng)人(rén)。


      基于16基因组合模型 (Detection Model 1) 的加权(quán)平均分分析(xī),发(fā)现无并发(fā)症病人的分数在(zài)训练集和测(cè)试集中都明显(xiǎn)低于有并发症的病(bìng)人。只考虑加权平(píng)均分的话(huà),受试者工作特征(zhēng)曲线(ROC)分析表明将cutoff值设置成0.5时,在测(cè)试组中中的灵敏度为(wéi)60%,特(tè)异(yì)性为100%。



      5hmC标志物可区分病人是单一并发症还(hái)是多种并发症


      50例有并(bìng)发症的2型(xíng)糖尿病病人被随(suí)机分(fèn)成训练(liàn)组(n=25)和测试组(n=25)。利用弹性网络筛选后发(fā)现,13基因-5hmC标志物组(zǔ)合(hé)可以(yǐ)区(qū)分2型糖尿病病人是(shì)否发生单一并发症或多(duō)种并发症。


      基(jī)于13基(jī)因组合模(mó)型 (Detection Model 2), 我们计算了单(dān)一并发症和(hé)多种并发症的加权平均分,发现在训练集和测试(shì)集中单一并发症(zhèng)和多种并发症病人的分数都有明(míng)显差异。值得(dé)一(yī)提(tí)的是,有(yǒu)肾病并(bìng)发症和无肾病并发症病人的分(fèn)数也有明显差(chà)异。利用加权平(píng)均分作为判断标准的受(shòu)试者工作特征曲线(xiàn)(ROC)表明,在测试组中当将cutoff值(zhí)设成0.69时,灵敏度(dù)为87.5%,特异性为68.8%。



      5hmC标(biāo)志物与传统临床(chuáng)变量(liàng)/危险因(yīn)子的(de)对比


      我们(men)评(píng)估了不同临床(chuáng)变量(liàng)/危险(xiǎn)因子用于监测(cè)血管并发症的灵敏度和特异性(见表1)。

      总(zǒng)体来说,结果表明一些临床(chuáng)变量(如尿液白蛋白、血清ALT、AST、肌酐、GGT、脂(zhī)蛋白a)虽然具(jù)有一定(dìng)的灵敏度和特异性,但(dàn)是整体准确度仍然差强人意(yì),因此临床需要更(gèng)加准确的方法。另外(wài),我(wǒ)们还在(zài)训练组(zǔ)中建立(lì)5hmC和不(bú)同临床变量的多变量(liàng)组合模型进行评估,该(gāi)模(mó)型加权平均分的AUC要(yào)明显大(dà)于传统临床变量(liàng)的AUC。若将(jiāng)这些临床变量与加权平均分进行结合,AUC也将进一步(bù)提高(gāo)。因此,该多(duō)变量模型表明加权平均分可(kě)作为一个独立(lì)的指标用(yòng)于监测2型(xíng)糖尿病血管并发(fā)症。

      信号通路分析和功能探究(jiū)


      有并发症和无并发症病人的135个差异候选基因(yīn)的功能注(zhù)释分析表明,这些(xiē)基因主(zhǔ)要(yào)富集在一些经典的(de)信号通路(lù)。错误(wù)发(fā)现率相(xiàng)关P值位于前10%和(hé)基(jī)因(yīn)数目≥3的信号通路包括由(yóu)IGF1R, IL-10和FGFR2所介(jiè)导的信号通路。由IGF1R和(hé)IL-10介导(dǎo)的信号通路与胰岛素抵抗及炎症(zhèng)反应相关,在血(xuè)管生物学和糖尿病发生发展过(guò)程中发挥重要作用。

      Reactome相互(hù)作用网络的(de)中心表明,泛(fàn)素(sù)编码基因[泛素B (UBB),泛素(sù)C (UBC),泛(fàn)素A-52亚基(jī)核糖体蛋白融合产物1(UBA52)]是候(hòu)选(xuǎn)基因(如SMAD3FOXD2DRAP1MCIDASMLNPIANPTBCC)的(de)重要连接者(zhě)。在这(zhè)135个(gè)差异候选基因中(zhōng), 一些基(jī)因 (如TNFRSF25P=0.027, HR=6.25; MLNP=0.0021, HR=20.40; CCL3L1P=0.018, HR=0.44)表现(xiàn)出与糖尿(niào)病病程相关的倾向,表明(míng)5hmC和糖尿病血管(guǎn)并(bìng)发症之(zhī)间可能存在(zài)时间依赖(lài)性的相互作用。基于纵向时间队列的大(dà)样本研究(jiū),将可进一步明确5hmC变化和糖尿病持续时间之间的动(dòng)态(tài)关联。关于单(dān)一并发症(zhèng)和多种并发症病人的159个候选标志(zhì)基因的功能注释(shì)研究(jiū)发现,存在细胞-细胞连接(jiē)、胶原蛋白形成、新陈代谢、细胞应激应答信(xìn)号通路的富集,这些信号通(tōng)路均(jun1)与(yǔ)细胞基(jī)本功能密切(qiē)相关(guān)。


      研究意义



      血管并发(fā)症是三分之二糖尿病病人(rén)的死亡原因,若(ruò)能(néng)及早有效控制血管并发症的发(fā)生,将极大地改善(shàn)糖(táng)尿病(bìng)病(bìng)人的生存(cún)质(zhì)量。该研究建立(lì)了一种利用cfDNA进行(háng)2型糖尿(niào)病血管并发症监测的(de)无创便捷方法,较目(mù)前临床标志物能更(gèng)准确地监控血管并发症的发生,从而提示临床及早采取应对措(cuò)施,有效(xiào)控制病情进展。



      合肥华体平台和中科金臻生(shēng)物医学有限公司(sī) 版权所有(yǒu) 皖ICP备16021320号-1 Designed by Wanhu

      华体平台-华体(中国)

      华体平台-华体(中国)